На пару дней лаги пропали, но со вчерашнего вечера пошло по-новой, и сейчас продолжается.
С учётом того, что я ничего так не менял, может всё же кто подскажет что-нибудь?

PHP код:
Трассировка маршрута к ggbest.ru [46.42.18.18]
с максимальным числом прыжков 30:

  1     2 ms    <1 мс    <1 мс  10.40.103.5
  2     1 ms    <1 мс     1 ms  10.55.18.25
  3     1 ms     1 ms     1 ms  vlan474.x650.cc0.pntl.ru [92.62.50.113]
  4     8 ms     1 ms     1 ms  vlan1783.x650.bm18.pntl.ru [92.62.48.158]
  5     1 ms     1 ms     1 ms  vlan185.7604.bm18.pntl.ru [89.223.25.174]
  6     1 ms     1 ms     1 ms  10.59.30.220
  7     1 ms     1 ms     3 ms  vlan179.mx480.bm18.pntl.ru [92.62.50.173]
  8     2 ms     1 ms     1 ms  ae0-77.mx240.b57.pntl.ru [188.65.69.5]
  9    13 ms    15 ms    15 ms  msk-bgw-crs3-1.megafon.ru [193.232.245.145]
 10    18 ms    18 ms    18 ms  access-46-42-18-18.kmtn.ru [46.42.18.18]

Трассировка завершена.